探针和引物之间的区别
目录:
主要区别——探针与引物
PCR 是一种生物技术中用于扩增特定 DNA 片段以用于各种目的的技术。探针和引物是两种类型的单链寡核苷酸,用于各种类型的 PCR。探针主要用于 qPCR,而合成引物则用于各种类型的 PCR。这 主要区别 探针和引物之间是探针是 探针用于通过与双链 DNA 杂交检测混合物中特定 DNA 片段的存在,而引物用于通过与单链 DNA 杂交引发聚合酶链反应.通常,引物用于启动细胞内的 DNA 复制。探针也用于杂交反应。
涵盖的关键领域
1. 什么是探针 – 定义、设计、重要性 2. 什么是引物 – 定义、设计、重要性 3.探针和引物有什么相似之处 – 共同特征概要 4. 探针和引物有什么区别 – 主要差异的比较
关键词:杂交、寡核苷酸、PCR、引物、探针、QPCR
什么是探针
探针是 DNA 或 RNA 片段,用于检测样品中特定 DNA 片段的存在。因此,探针可用于两种类型的技术,即 qPCR 和杂交反应。在设计探头时应考虑四个因素。
- 地点 – 探针应与靠近反向或正向引物的 DNA 链杂交。但是,它不应与引物结合位点重叠。通常,探针与 DNA 双链体的任一链杂交。
- 熔化温度(Tm) – 探针的解链温度应比引物的解链温度高 6-8 °C。
- 退火温度(Ta) – 实验的退火温度应比引物的熔解温度低 5 °C。
- GC含量 – 探针的 GC 含量应为 35-65%。探针的 5' 端不应包含 G。
在 qPCR 中,探针用荧光染料或放射性元素标记。这些探针与 DNA 双链体中的目标序列杂交。不同类型的标记探针(带有放射性元素或荧光)也用于各种类型的杂交反应。 PNA探针与其靶序列的杂交如图1所示。 PNA 探针用于确定端粒的长度。
图 1:PNA 探针的杂交
在杂交过程中,探针以互补方式与单链 DNA 结合。
什么是引物
引物是指 DNA 或 RNA 的短链,作为 DNA 合成的起点。在细胞内使用 RNA 引物在 DNA 聚合酶的帮助下启动 DNA 复制。合成 DNA 引物主要用于 PCR 以扩增所需的 DNA 片段。目标序列的两侧是两个引物,称为正向引物和反向引物。 特异性 和 互补性 是引物设计的主要因素。还应避免二级结构。设计引物时应考虑的其他因素如下所述。
- 熔化温度(Tm) – 正向和反向引物的最佳熔解温度应为 60-64 °C。
- 退火温度 – 实验的退火温度应比每个引物的熔解温度低 5 °C。
- GC含量 – 引物的 GC 含量应为 35-65%。
正向和反向引物与目标 DNA 的两条链的退火如图 2 所示。
图 2:引物退火
在 DNA 测序中,引物用于扩增目标片段。引物可以用放射性元素或荧光标记以用于各种检测目的。
探针和引物之间的相似之处
探针和引物之间的区别
定义
探测: 探针是 DNA 或 RNA 片段,用于检测样品中特定 DNA 片段的存在。
入门: 引物是 DNA 或 RNA 的短链,作为 DNA 合成的起点。
角色
探测: 探针用于检测 qPCR 中的特定 DNA 片段。
入门: 引物用于启动 DNA 复制。它还用于启动 PCR。
长度
探测: 探针的长度范围为 25-1000 个碱基对。
入门: 引物的长度范围为 18-22 个碱基对。
杂交
探测: 探针与双链 DNA 杂交。
入门: 引物与单链 DNA 杂交。
标签
探测: 探针通常用荧光团标记以进行检测。
入门: 可以根据目的标记引物。
结论
探针和引物是用于各种类型 PCR 的两种单链寡核苷酸。探针用于检测 qPCR 中的特定 DNA 片段。引物用于启动细胞内的 DNA 复制,也用于启动 PCR。因此,探针和引物之间的主要区别在于它们的用途。
参考:
1. 设计 PCR 引物和探针,集成 DNA 技术,可在此处获得。
图片提供:
1. “Q-FISH 工作流程”,作者 Jclam 在英文维基百科 (CC BY 3.0) 上通过 Commons Wikimedia2。 Richard Wheeler (Zephyris) 的“Primers RevComp Elongation” – 通过 Commons Wikimedia 自己的作品 (CC BY-SA 3.0)