Southern Blotting 是如何工作的
目录:
Southern印迹是一种用于检测样品中特定DNA片段的技术。印迹技术包括通过凝胶电泳根据大小分离 DNA 片段,将大小分级的 DNA 样品转移到滤膜上,将特定 DNA 片段与标记的序列特异性探针杂交,并检测标记的条带。
除了鉴定样品中的特定 DNA 外,特定类型 DNA 的大小和丰度也可以通过 Southern 印迹法确定。本文描述了Southern印迹涉及的过程。
涵盖的关键领域
1. 什么是Southern Blotting – 定义、原理、应用 2. Southern Blotting 如何工作 – 南方印迹的过程
关键词:DNA、凝胶电泳、杂交探针、尼龙膜、限制性消化、Southern Blotting
什么是Southern Blotting
Southern印迹是一种用于鉴定样品中特定DNA的杂交技术。该技术由 Edward M. Southern 于 1975 年首次开发。该过程可识别样本中特定 DNA 序列的 DNA 序列、大小和丰度。
Southern印迹膜如图1所示。
图 1:Southern 印迹膜
Southern印迹的应用
Southern印迹的应用描述如下。
- 检测特定的 DNA 片段
- 分离特定的 DNA 片段
- 识别突变和基因重排
- 在 RFLP 分析中(限制性片段长度多态性)
- 识别遗传病
- 识别传染源
- 亲子鉴定
- 在 DNA 指纹识别中识别罪犯
Southern Blotting 是如何工作的
Southern印迹涉及通过凝胶电泳根据大小分离DNA片段,将它们转移到膜上,将它们与标记的序列特异性探针杂交,并检测标记的条带。 Southern印迹的步骤如下所述。
- DNA消化 – DNA 样品通过限制性内切酶消化获得 DNA 片段,并通过 PCR 扩增这些片段。
- 凝胶电泳——DNA 片段通过凝胶电泳进行大小分级。
- 变性 – 将含有分离 DNA 的凝胶浸泡在 NaOH 或 HCl 中,使双链 DNA 变性。
- 印迹 – 凝胶中的 DNA 片段通过称为印迹的过程转移到带正电荷的尼龙膜中。
- 烘烤和阻塞 – 将带有 DNA 片段的吸墨纸烘烤以将 DNA 固定在膜上。然后,未占据的结合位点通过用牛血清白蛋白 (BSA) 或酪蛋白处理而饱和。
- 与标记探针杂交 – DNA 结合膜用标记探针处理,探针包含与感兴趣的 DNA 片段互补的核苷酸序列。杂交探针的长度一般为 100-500 bp,并用放射性核苷酸标记。
- 通过放射自显影进行可视化 – 在放射自显影下观察结合探针的膜,以获得感兴趣的 DNA 片段的模式。
图 2:Southern 印迹
Southern印迹的整个过程如图2所示。
结论
Southern印迹是一种杂交技术,用于从样品中鉴定特定的DNA序列。在此过程中,DNA 样本通过限制性内切酶进行分离,并将混合物在凝胶上运行。然后,凝胶中的条带图案被转移到尼龙膜上,并与标记探针杂交,从而可以检测到感兴趣的片段。
参考:
1. “南方印迹”。 Thermo Fisher Scientific,可在此处获得。
图片提供:
1. Bojan Žunar 的“Southern 印迹膜” – 自己的作品(CC BY-SA 4.0),来自 Commons Wikimedia2。 “图 17 01 05” 作者:CNX OpenStax – (CC BY 4.0) 通过 Commons Wikimedia