如何阅读质粒图谱
目录:
质粒图谱是质粒内元件的相对位置。可以通过了解质粒的特征来阅读质粒图谱。它们是质粒的名称和大小、质粒的元素、它们的相对位置以及启动子的方向。复制起点 (ORI)、抗生素抗性基因、多克隆位点 (MCS)、插入片段或感兴趣的基因、启动子区域、选择标记和引物结合位点是质粒的组成部分。质粒中元件的相对位置可以通过对质粒作图来确定。质粒作图所涉及的过程称为限制性作图。
涵盖的关键领域
1. 什么是质粒图谱 – 定义、限制映射 2. 如何阅读质粒图谱 – 质粒 MapP 的特征
关键词:元素、质粒的名称和大小、启动子的方向、质粒图谱、限制性酶、限制性作图
什么是质粒图
质粒图是质粒的图形表示,它显示了质粒的主要标志或元件的位置。质粒内元件的相对位置可以通过以下方式确定 限制映射.限制性图谱是特定质粒内限制性识别位点的图谱。因此,它参与了限制酶对质粒的消化。限制图如图1所示。
图 1:限制地图
在限制映射中可以使用两种方法:
1. 限制性消化
– 用一种或两种限制性内切酶对质粒进行限制性消化
– 根据质粒产生的片段大小绘制质粒图
2. 测序
– 对整个质粒进行测序
– 质粒元件的鉴定
如何阅读质粒图谱
图 2:质粒图
质粒图谱的阅读主要集中在质粒的特征上。他们是;
1. 质粒名称及大小
2. 质粒的组成部分 –
3. 质粒内元件的相对位置
4、启动子的定位
结论
通过了解质粒图的特征,例如质粒的名称和大小、质粒中元件的类型及其相对位置以及启动子的方向,可以阅读质粒图。
参考:
1.“什么是质粒?” Addgene ,可在此处获得。
图片提供:
1. “PDONR221 Map” By Nothingserious – 分析序列:pDONR221。添加基因。 2016 年 1 月 24 日(CC0)通过 Commons Wikimedia 检索。 2. Magnus Manske 的“PGEX-3X 克隆载体”——由 Magnus Manske(CC BY-SA 3.0)通过 Commons Wikimedia 创建