琼脂糖和聚丙烯酰胺有什么区别
目录:
这 主要区别 琼脂糖和聚丙烯酰胺的区别在于 琼脂糖在琼脂糖凝胶电泳 (AGE) 中主要用于 DNA 的分离,而聚丙烯酰胺在聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE) 中主要用于蛋白质的分离。 此外,琼脂糖可以分离 50-20, 000 bp 大小的 DNA 片段,而聚丙烯酰胺具有更高的分辨能力,最多可分离 5-500 bp 的 DNA 片段。此外,琼脂糖凝胶水平运行时平放在桌子上,而聚丙烯酰胺凝胶垂直运行时站在桌子上。
琼脂糖和聚丙烯酰胺是两种主要类型的凝胶,用于根据大分子的大小和电荷分离大分子,包括 DNA、RNA 和蛋白质。
琼脂糖、DNA、凝胶电泳、聚丙烯酰胺、分辨力
什么是琼脂糖
琼脂糖是用于琼脂糖凝胶电泳 (AGE) 的天然多糖聚合物。然而,它是一种复杂的分子混合物,琼脂糖的主要成分是琼脂。重要的是,在琼脂糖凝胶中,可以根据 DNA 的大小分离大片段。通常,DNA 是带负电荷的分子,它在电场作用下向正极运行。此外,琼脂糖凝胶内的孔负责按大小分离 DNA。
图 1:琼脂糖凝胶电泳
此外,琼脂糖凝胶是由螺旋琼脂糖分子组成的 3D 基质,这些分子聚集成通道和孔。尽管如此,它的孔径并不均匀。因此,结果很难重现。另一方面,它易于处理和铸造。此外,当凝胶冷却时琼脂糖凝固。
什么是聚丙烯酰胺
聚丙烯酰胺是用于制备聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE) 的物质。基本上,它是两个分子交联的产物;丙烯酰胺和双丙烯酰胺。此外,丙烯酰胺是丙烯腈通过腈水合酶水合的产物。除此之外,它是粉末形式,对人类的神经系统有毒。随着水的加入,丙烯酰胺聚合成聚丙烯酰胺。
图 2:页面
琼脂糖和聚丙烯酰胺之间的相似之处
琼脂糖和聚丙烯酰胺的区别
定义
琼脂糖是所用琼脂的主要成分,尤其是用于电泳凝胶。聚丙烯酰胺是由丙烯酰胺聚合而成的合成树脂。它是一种水溶性聚合物,用于形成稳定的凝胶。
制作
琼脂糖是一种源自海藻的复杂多糖,而丙烯酰胺是通过腈水合酶消化丙烯腈制成的。
作品
琼脂糖由许多分子组成,而聚丙烯酰胺包含一个大分子。
凝胶
琼脂糖凝胶包含长链相互连接的糖以形成网状结构,而聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺和双丙烯酰胺的化学交联组成,产生分子筛。
环境
琼脂糖在冷却时凝固,而聚丙烯酰胺在交联发生后通过化学反应凝固。
运行配置
琼脂糖是水平凝胶,而聚丙烯酰胺是垂直凝胶。
特性
随着凝胶中琼脂糖浓度的增加,琼脂糖凝胶的孔径变小。但是,丙烯酰胺与双丙烯酰胺的比例决定了聚丙烯酰胺凝胶的孔径。
凝胶的典型浓度
琼脂糖凝胶的典型浓度约为 0.5 至 2%,而聚丙烯酰胺凝胶的典型浓度约为 6-15%。
生物分子的分离
琼脂糖凝胶主要用于分离更大的 DNA 片段,例如 PCR 产物,而聚丙烯酰胺凝胶对于分离蛋白质和小核酸(例如寡核苷酸、miRNA、tRNA 等)很重要。
DNA的分离
琼脂糖可以分离大约 50-20, 000 bp 的 DNA,而聚丙烯酰胺可以分离大约 5-500 bp 的 DNA。
解析力
琼脂糖凝胶的分辨率较低,而聚丙烯酰胺凝胶的分辨率较高。
DNA配置
琼脂糖凝胶通常以双链形式分离 DNA,而聚丙烯酰胺凝胶以单链形式分离 DNA。
优点
琼脂糖凝胶无毒且易于处理,而聚丙烯酰胺凝胶可提供可重现的结果。
缺点
琼脂糖凝胶的孔径不均匀,而聚丙烯酰胺凝胶含有强效神经毒素。
结论
琼脂糖是海藻的多糖,在凝胶生产中很重要,主要用于分离 DNA 的大片段。此外,它是一种分辨率较低的水平凝胶。另一方面,聚丙烯酰胺是另一种凝胶,主要用于蛋白质的分离。此外,由于其高分辨率,它在小核酸的分离中很重要。除此之外,它是由丙烯酰胺和双丙烯酰胺通过化学反应交联而成的。另一方面,聚丙烯酰胺是一种垂直凝胶。因此,琼脂糖和聚丙烯酰胺之间的主要区别在于成分、凝固和分辨率。
参考:
1. 克洛尔,亚当。 “运行琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶。”集成 DNA 技术,Integrated DNA Technologies, Inc.,2017 年 9 月 20 日。可在此处获取。
图片提供:
1. “电泳 - 沿凝胶移动”,迈克尔 - 通过 Commons Wikimedia 移动(CC BY 2.0) 2. “Gelelektrophoreseapparatur”(CC BY-SA 3.0),来自 Commons Wikimedia