密码子和反密码子的区别

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主要区别 – 密码子与反密码子

密码子和反密码子是核苷酸三联体,它们指定多肽中的特定氨基酸。存在特定的规则集用于将遗传信息存储为 DNA 或 mRNA 分子上的核苷酸序列,以便合成蛋白质。该特定规则集称为遗传密码。密码子是一组三个核苷酸,尤其是在 mRNA 上。反密码子存在于 tRNA 分子上。这 主要区别 密码子和反密码子之间是 密码子是表示 mRNA 分子上的氨基酸的语言,而反密码子是 tRNA 分子上密码子的互补核苷酸序列。

本文考察,

1. 什么是密码子——定义、特征 2. 什么是反密码子——定义、特征 3. 密码子和反密码子有什么区别

什么是密码子

密码子是由三个核苷酸组成的序列,它指定了多肽链中的一个氨基酸。每个编码特定蛋白质的基因都由一个核苷酸序列组成,这些核苷酸代表该特定蛋白质的氨基酸序列。基因利用通用语言遗传密码来存储蛋白质的氨基酸序列。遗传密码由称为密码子的核苷酸三联体组成。例如,密码子 TCT 代表氨基酸丝氨酸。可以鉴定 61 个密码子以指定翻译所需的 20 个必需氨基酸。

阅读框

单链 DNA 分子中的特定核苷酸序列由链的 5' 到 3' 方向的三个阅读框组成。考虑图1中的核苷酸序列,第一个阅读框从第一个核苷酸A开始。第一个阅读框以蓝色显示。它包含密码子 AGG TGA CAC CGC AAG CCT TAT ATT AGC。第二个阅读框从第二个核苷酸 G 开始,以红色显示。它包含密码子 GGT GAC ACC GCA AGC CTT ATA TTA。第三个阅读框从第三个核苷酸 G 开始,以绿色显示。它包含密码子 GTG ACA CCG CAA GCC TTA TAT TAG。

图 1:阅读框架

由于 DNA 是双链分子,因此可以在两条链中找到六个阅读框。但是,只有一种阅读框架有可能被翻译。该阅读框称为开放阅读框。密码子只能用开放阅读框识别。

起始/终止密码子

开放阅读框的定义基本上是由 mRNA 编码的起始密码子的存在。通用起始密码子是 AUG,它编码真核生物中的氨基酸甲硫氨酸。在原核生物中,AUG 编码甲酰甲硫氨酸。真核开放阅读框架因框架中间存在内含子而中断。翻译在开放阅读框中的终止密码子处停止。在 mRNA 上发现了三个通用终止密码子:UAG、UGA 和 UAA。 mRNA 片段上的密码子系列如图 2 所示。

图 2:mRNA 上的密码子系列

突变的影响

复制过程中会发生错误,从而导致核苷酸链发生变化。这些变化称为突变。突变可能会改变多肽链的氨基酸序列。两种类型的点突变是错义突变和无义突变。错义突变通过改变氨基酸残基来改变多肽链的特性,它们可能导致镰状细胞性贫血等疾病。无义突变会改变终止密码子的核苷酸序列,并可能导致地中海贫血。

退化

遗传密码中出现的冗余称为简并性。例如,密码子 UUU 和 UUC 都指定了氨基酸苯丙氨酸。 RNA密码子表如图3所示。

图 3:RNA 密码子表

密码子使用偏差

特定密码子在基因组中出现的频率称为密码子使用偏好。例如,密码子UUU在人类基因组中的出现频率为17.6%。

变化

在考虑人类线粒体基因组时,可以发现标准遗传密码存在一些变异。一些支原体物种还将密码子 UGA 指定为色氨酸而不是终止密码子。一些念珠菌物种将密码子 UCG 指定为丝氨酸。

什么是反密码子

tRNA 上的三个核苷酸序列与 mRNA 上的密码子序列互补,称为反密码子。在翻译过程中,反密码子通过氢键与密码子互补碱基配对。因此,每个密码子在不同的 tRNA 分子上都包含一个匹配的反密码子。反密码子与其密码子的互补碱基配对见图4。

图 4:互补碱基配对

摆动底座配对

单个反密码子与 mRNA 上的一个以上密码子进行碱基配对的能力称为摆动碱基配对。摆动碱基配对的发生是由于 tRNA 分子上第一个核苷酸的丢失。肌苷存在于 tRNA 反密码子的第一个核苷酸位置。肌苷可以与不同的核苷酸形成氢键。由于存在摆动碱基配对,氨基酸由密码子的第三个位置指定。例如,甘氨酸由 GGU、GGC、GGA 和 GGG 指定。

RNA的转移

可以找到 61 种不同类型的 tRNA,以指定 20 种必需氨基酸。由于摆动碱基配对,许多细胞中不同 tRNA 的数量减少。翻译所需的不同 tRNA 的最少数量为 31。 tRNA分子的结构如图5所示。反密码子以灰色显示。以黄色显示的受体茎在分子的 3' 末端包含一个 CCA 尾。指定的氨基酸与 CCA 尾部的 3' 羟基共价结合。与氨基酸结合的 tRNA 称为氨酰 tRNA。

图 5:RNA 的转移

密码子和反密码子的区别

地点

密码子: 密码子位于 mRNA 分子上。

反密码子: 反密码子位于 tRNA 分子中。

互补性质

密码子: 密码子与 DNA 中的核苷酸三联体互补。

反密码子: 反密码子与密码子互补。

连续性

密码子: 密码子依次存在于 mRNA 上。

反密码子: 反密码子单独存在于 tRNA 上。

功能

密码子: 密码子决定了氨基酸的位置。

反密码子: 反密码子通过密码子带来指定的氨基酸。

结论

密码子和反密码子都涉及以正确的顺序定位氨基酸,以便在翻译过程中合成功能性蛋白质。它们都是核苷酸三联体。可以找到 61 个不同的密码子,指定合成多肽链所需的 20 种必需氨基酸。因此,需要 61 个不同的 tRNA 才能与 61 个密码子互补碱基配对。但是,由于摆动碱基配对的存在,所需的 tRNA 数量减少到 31 个。与密码子的反密码子互补碱基对被认为是一种普遍特征。因此,密码子和反密码子之间的主要区别在于它们的互补性。

参考:“遗传密码”。维基百科,免费百科全书,2017 年。2017 年 3 月 3 日访问“转移 RNA”。维基百科,免费百科全书,2017 年。2017 年 3 月 3 日访问

图片提供:Hornung Ákos 的“阅读框架”——自己的作品(CC BY-SA 3.0)来自 Commons Wikimedia “RNA-codon” 原上传者是英语维基百科的 Sverdrup——从 en.wikipedia 转移到 Commons。,公共领域)通过Commons Wikimedia “06 chart pu” NIH –(公共领域)通过Commons Wikimedia “Ribosome” 通过pluma – 自己的作品(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia “TRNA-Phe 酵母1ehz” 作者Yikrazuul – 自己的作品(CC BY-SA 3.0)通过Commons Wikimedia

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