外显子组和转录组之间的区别

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主要区别 外显子组和转录组之间是 外显子组是基因组中蛋白质编码基因中所有外显子的完整序列,而转录组是源自蛋白质编码基因的信使 RNA 分子的集合。 此外,外显子组占总基因组序列的 1-2%,而转录组占细胞总 RNA 的不到 4%。

外显子组和转录组是基因组中蛋白质编码基因的两个序列集合。两者在基因组研究和疾病诊断中都有各种应用。

涵盖的关键领域

1.什么是外显子组 – 定义、事实、技术 2.什么是转录组 – 定义、事实、技术 3. 外显子组和转录组有什么相似之处 – 共同特征概要 4. 外显子组和转录组有什么区别 – 主要差异的比较

关键术语

外显子、外显子组、mRNA、蛋白质编码基因、转录组

什么是外显子组

外显子组是特定生物体基因组蛋白质编码基因中外显子的集合。基因组的编码序列聚集成基因,这些基因可以编码蛋白质或 RNA。在原核基因组中,编码序列不被其他序列中断,而在真核基因组中,基因的编码序列被称为内含子的非编码序列中断。因此,聚集的编码序列称为外显子。

图 1:外显子和内含子

在蛋白质编码基因中,RNA 聚合酶在转录过程中将内含子和外显子转录为前体 mRNA。在以下转录后修饰期间去除掺入的内含子。外显子组研究中使用的主要技术是全外显子组测序(WES)。 WES 参与特定基因组的片段化 DNA 的杂交,以识别目标 DNA 序列,然后进行测序。

什么是转录组

转录组是细胞中表达的 mRNA 的总集合。它占细胞总RNA的不到4%。由于转录组指定了蛋白质组的组成,它决定了该特定细胞的生化能力。此外,特定细胞的转录组无法合成,在细胞分裂过程中,它总是从母细胞传到子细胞。因此,转录,即产生 RNA 的过程,是维持转录组的步骤。

图 2:多能细胞的转录组

另一方面,虽然每个细胞都包含产生物种整个转录组的信息,但细胞中的表达基因也取决于环境因素。转录组研究中使用的两种主要技术是微阵列和 RNA-seq。

外显子组和转录组之间的相似性

外显子组和转录组之间的区别

定义

外显子组是指由外显子组成的基因组部分,它编码蛋白质合成的信息,而转录组是指生物体基因中表达的所有信使 RNA 分子的总和。因此,根据这个定义,外显子组和转录组之间的主要区别是不言自明的。

意义

因此,外显子组是蛋白质编码基因中外显子的总集,而转录组是细胞中表达的 mRNA 的总集。

DNA或RNA

此外,外显子组由 DNA 组成,而转录组由 RNA 组成。

数量

外显子组占总基因组的 1-2%,而转录组占细胞总 RNA 的不到 4%。

等级

外显子组和转录组之间的另一个区别是外显子组处于基因组水平,而转录组处于转录水平。

技巧

此外,全外显子组测序是确定外显子组的技术,而微阵列和 RNA-seq 确定转录组。

结论

外显子是由基因组的 WES 确定的基因组中的整套外显子。因此,外显子组是一个基于 DNA 的概念。但是,转录组是一个基于 RNA 的概念,因为它是细胞的整个 mRNA 集。外显子组和转录组之间的主要区别在于它们的概念。

参考:

1. 瓦尔、阿曼达等人。 “外显子组测序:当前和未来展望。” G3:基因|基因组|遗传学 5.8(2015):1543-1550。管理中心。网。 2018 年 9 月 6 日。在此处提供2。棕色TA。基因组。第 2 版。牛津:Wiley-Liss; 2002. 第 3 章,转录组和蛋白质组。在这里可用

图片提供:

1. 国家人类基因组研究所的“DNA 外显子内含子”——(公共领域)通过 Commons Wikimedia 2.“多能细胞的转录组”,Grskovic, M. 和 Ramalho-Santos, M.,多能转录组(10 月 10 日, 2008),StemBook,编辑。干细胞研究社区,StemBook,doi/10.3824/stembook.1.24.1,http://www.stembook.org。 – [1] DirectStemBook 图 2 多能细胞的转录组。Grskovic, M. 和 Ramalho-Santos, M.,多能转录组(2008 年 10 月 10 日),StemBook,编辑。干细胞研究社区,StemBook,doi/10.3824/stembook.1.24.1,http://www.stembook.org。 (CC BY 3.0)通过Commons Wikimedia

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